Franck Ghitalla, pionnier des web studies en France : cartographier le web

Qu’est-ce que la cartographie du web&nbsp?

Un livre essentiel pour tous ceux qui travaillent à l’analyse de réseaux et du web en particulier, à sa visualisation, à son histoire. Franck Ghitalla, collègue et ami, décédé en 2018 dans son amphithéâtre à l’UTC, avait préparé soigneusement cette édition de ses carnets d’exploration du web. Nous (Mathieu Jacomy et moi) avons repris l’ouvrage pour le finaliser. Il est désormais disponible en open science (accès libre en ligne et impression à la demande) sur Open editions, avec des visuels superbes et des explications très didactiques de chaque étape et chaque problème d’exploration des topologies comme celle du Web (mais pas que). Heureux de pouvoir faire vivre sa mémoire, de continuer à faire vivre ces réseaux et de rendre visibles la rigueur et l’imagination de Franck Ghitalla, fondateur des web studies en France, ami trop tôt disparu…

Dans le livre, on trouve trace de son intérêt croissant pour l’analyse des propagations, d’abord en termes de suivi temporel des graphes, très complexe à réaliser, même avec des graphes multiniveaux, et ensuite comme objet d’étude à part entière. Nous en avions discuté et nous avions des projets ensemble, notamment sur les questions de suivi des réseaux et des messages terroristes. Mais sa disparition a tout interrompu. Je pense à lui à chaque fois que nous manipulons des graphes et plus souvent encore!

https://books.openedition.org/oep/15358

Un virus, c’est un algo de variation finalement

Un article très documenté et passionnant sur le blog du Monde de Marc Gozlan. Vraiment nous n’en avons pas fini avec les variants puisque c’est le principe même du virus pour survivre (en mutant ou en se recombinant). Tant que l’on ne l’a pas stoppé par vaccination, immunité ou gestes barrières, il continue et la description phylogénétique peut désormais se faire même prédictive. Au fond, nos actions peuvent limiter les occasions de réplications et de variations et pousser à la sélection de certains variants pour espérer au bout du compte l’épuisement du virus mais après la lecture de cet article, on en est moins sûr. Bref, le champion des propagations, c’est bien le Sars-Cov2 avec tous ses variants (notamment en recombination). Et ses méthodes de variation et  d’accrochage des cellules humaines décrites dans l’article nous serviront aussi pour tester des analogies dans les propagations sociales.

https://www.lemonde.fr/blog/realitesbiomedicales/2021/07/08/covid-19-alpha-beta-gamma-delta-epsilon-lemergence-sans-fin-des-variants/

 

Le biais Bronner ou la reductio ad cerebrum

N’est pas Molière qui veut mais ma critique du livre de Bronner « Apocalypse cognitive », pourrait se contenter de transposer la réplique fameuse : « Le poumon ! Le poumon, vous dis-je » en un « Le cerveau ! Le cerveau, vous dis-je ! ». La discussion académique exige cependant un peu plus d’arguments. Pourtant, le livre en question a débordé largement le monde universitaire pour être mentionné, voire célébré, partout dans les médias, avec une telle unanimité, que je me demande si les critiques l’ont vraiment lu, sans parler des académiques qui auront vite compris l’opération éditoriale. Pour tous ceux qui ne l’ont pas lu, donc, je vais donc résumer l’argument le plus honnêtement possible et j’en reprendrai chaque point en détail. Version longue d’un article publié dans la revue en ligne AOC début Avril 2021.

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Ne pas confondre études de propagation et prédictions

Ioannidis et ses collègues ont publié un article en Aout 2020 qui montrait comment les épidemiologistes qui ont prétendu faire des prédictions pour l’épidémie du Covid-19 se sont totalement trompés, et ça n’a pas dû s’arranger depuis avec l’histoire des variants. Leur papier permet de lister tous les risques de défauts de ces études et ces leçons peuvent servir à toutes les études de propagation et à tous les data scientists formatés par le pouvoir de prédiction du Machine learning.

Dans l’image ci dessus, on peut voir les prédictions de 4 modèles (issus de labos différents) pour le nombre de morts aux USA pour le jour suivant: pas un ne donne le même résultat!!

Suivre la propagation d’un concept vide

Travail passionnant que celui de David Chavalarias sur la diffusion du terme « islamogauchisme » et qui aide à mieux comprendre son origine et ses liens. En fait, ce n’est pas une étude de propagation en tant que telle puisqu’on ne dispose que d’une timeline cumulative d’un côté et des réseaux d’hyperliens entre émetteurs par ailleurs. Mais cela constitue une approximation suffisante pour comprendre la manoeuvre politique qui est en cours pour faire exister un concept vide qui permettra de cadrer le débat politique à venir. Le rôle décisif des ministres dans cette propagation mérite d’être soulignée car on ne peut ignorer que des influenceurs d’un statut particulier peuvent modifier considérablement la carrière d’un mème comme celui-là, surtout lorsque les mass media les relaie sur les plateaux télé. Il faudrait sans doute tenter encore d’avancer vers un carte dynamique de tout le parcours de ce mème pour avoir une idée plus précise non seulement des influenceurs qui ont pu faire monter la réputation du terme mais aussi des dérivations multiples qui ont pu affecter le mème en question et des associations durables qui ont pu être véhiculées comme des clusters qui se propagent ensemble. Ce sont là les limites des techniques actuelles de visualisation des liens, même si l’institut des systèmes complexes d’Ile de France a réalisé aussi des visualisation en flux auparavant.

“Islamogauchisme” : Le piège de l’Alt-right se referme sur la Macronie

Les mots du confinement et leur pouvoir – Webinar Sciences Po: Karim Duval dialogue avec Dominique Boullier

La vidéo de Karim Duval sur le mot confinement (voir post ci dessous) a connu un vrai succès et a fait beaucoup rire… et penser! Elle met en scène la vie d’un mot soudan célèbre: « confinement ». Elle correspond exactement aux travaux que conduit Dominique Boullier sur les propagations ( de thèmes, de termes et de mèmes), notamment pendant la pandémie. Ce dialogue entre un artiste et un universitaire se veut une occasion de déconfiner les modes de pensée pour introduire les notions de base d’une science des propagations. Une heure de gai savoir! ( à condition d’avoir vu la vidéo auparavant!

 

 

A propos de « Analyser la réactivité des gouvernements à la pandémie » de PA Rosental: effets des structures sanitaires ou effets de propagations?

Le Maroc risque-t-il d'importer le Coronavirus? | Challenge.ma

Où l’on voit que la notion de « bien préparé » établie à un temps t a laissé place à quelques surprises de taille, une fois la crise engagée! Attention, cette image est une illustration totalement distincte de la thèse de PA Rosental. Elle sert seulement à donner un exemple visuel de ces différences d’appréciation des performances des systèmes d’information dans le monde.

Paul-André Rosental, mon collègue de Sciences Po, a publié une note très détaillée d’analyse de la réactivité des gouvernements comparée entre pays, pour vérifier si l’état des structures de santé pouvait expliquer les différences assez nettes entre les pays. Il est vraiment intéressant à lire ici. Pour ceux qui sont un peu effrayés par les stats, j’en fais un commentaire qui permet de mettre en perspective ce qu’un point de vue selon lequel les structures sociales ( ici sanitaires) agissent ( ce que j’appelle la Première génération) et un autre point de vue selon lequel la propagation des influences et des imitations entre pays rend compte des réactivités différentes. Et Paul-André Rosental répond à mon commentaire sur ce blog, ici Les deux points de vue sont légitimes, et j’insiste bien sur les qualités du travail de PA Rosental et sur l’intérêt de l’exploitation des données enregistrées par les états mais aussi sur leurs limites en particulier lorsqu’il s’agit de rendre compte de la réactivité des gouvernements, un domaine politique où les discours, les méthodes, les influences circulent. Son travail très minutieux montre à quel point il est difficile  de faire de la recherche sur ces données mal calibrées ou calibrées différemment selon les pays et surtout en situation d’urgence. Mais comme il rend compte de toutes ses difficultés et de tous ses choix de méthodes avec une grande honnêteté, c’est une chance de pouvoir discuter de cela avec lui. D’autant plus qu’il a accepté d’y répondre dans le billet suivant, ce qui représente un beau moment de controverse amicale et approfondie sur nos propres choix de recherche, sur leurs limites et sur leurs a priori. Merci à Paul-André pour ce magnifique travail et pour cette discussion.


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Une réponse de Paul André Rosental: « On s’engage et on voit ». Saisir à vif le choc épidémique

Réponse de Paul-André Rosental au Commentaire de Dominique Boullier

Merci de ta lecture et de tes commentaires. Les « contraintes de validation » dont tu parles ont du bon, et je lis aussi ton intervention comme un rapport de referee qui m’aidera à améliorer une prochaine version de mon travail, ce qui m’est très précieux. Parmi les faiblesses que je reconnais dans mon analyse, et bien que j’aie eu la chance de beaucoup la discuter et faire circuler, il y a celle de ne pas être passé par les procédures d’évaluation par les pairs, qui font la spécificité de notre métier.

Je vais m’efforcer de ne pas être long. Je tenterai d’apporter quelques précisions, dont tu me fais comprendre qu’elles sont sans doute manquantes, ou insuffisamment appuyées, dans mon texte. Puis je ferai un double point plus général.

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Quand un humoriste fait de l’excellente théorie sociale: le mot confinement sort de l’ombre!

Karim Duval est une merveilleux linguiste (tous ses sketches sont à mourir de rire, voir toute sa chaine You Tube), mais cette vidéo là est un chef d’œuvre.  Il met en scène parfaitement ce qu’est une théorie des propagations , de la mémétique, centrée sur la vie des mots et leur pouvoir d’agir. En l’occurrence d’ailleurs, « confinement » se plaignait de son sort et il ne sait pas trop ce qui lui arrive. Des pages entières de Daniel Dennett relate cette histoire version théorique, avec assez d’humour aussi, mais là Karim Duval est au top. Nous sommes traversés par ces mots qui soudain décollent du dictionnaire stock pour devenir des flux de conversations, pendant que d’autres se morfondent et ne renaitront peut être jamais …. mais qui sait? Et son petit frère déconfinement le morveux qui veut lui manger la laine sur le dos, excellente illustration de la compétition des mèmes et des mots dans notre système attentionnel.

Déconfinement et rétropropagation : méditations analogistes

12.4.7-Fonctionnement rétropropagation du gradient Calcul des ...

Diagramme de rétropropagation du gradient de l’erreur dans un réseau de neurones en Machine Learning (Gilles Le Bris)

Puisque nous parlons de déconfinement, je voudrais m’attarder sur le concept de rétropropagation. Une première partie traitera de la propagation des messages qui vont orienter le déconfinement avec l’effet paradoxal de la démobilisation que cela peut entrainer. La seconde partie exploitera plusieurs analogies dans des disciplines diverses à partir du concept de rétropropagation qui me vient de la science des données et du Machine Learning pour voir précisément ce que l’on peut en apprendre pour les propagations et les méthodes à mettre en place. Il ne s’agit plus de l’origine des propagations (voir le billet sur le sujet) ni même exactement de leur fin mais de la boucle possible de réversion qu’elles peuvent ou non effectuer.

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Ce que la phylodynamique en virologie peut nous apprendre pour l’étude des réplications

(cliquer pour voir l’image nette)

L’article du Monde sur la phylodynamique et le site Nextstrain sont des sources de réflexion sans fin pour ceux qui travaillent sur les propagations. Sur le plan conceptuel, sur le plan empirique des descriptions et sur le plan de la dataviz qui est réellement inspirante avec les mêmes problèmes que ceux que l’on rencontre dans le suivi des réplications. Voici quelques-unes de ces inspirations possibles qui plaident pour une rencontre plus étroite entre sciences sociales et sciences médicales.

  • Ce qui reste d’un hôte dans un virus et dans un même : problème de généalogie
  • L’enjeu des rythmes
  • Granularité de l’analyse : traits sémiotiques et protéines
  • Data viz
  • Analyses et aide à la décision

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Traçage en temps de pandémie : design imitatif ou design centré citoyen ?

Légende: carte dynamique des flux depuis Wuhan New York Times

La nécessité du traçage numérique s’est désormais installée dans les débats et, sondage d’opinion à l’appui, dans les esprits aussi. Trois argument clés :1/ la Corée et Singapour l’ont fait (évitons de parler de la Chine, le modèle fait un peu repoussoir), pourquoi pas nous ? 2/ il existe des techniques pour suivre qui on veut où l’on veut, pourquoi ne pas les utiliser ? 3/ La priorité, c’est la sécurité entendue comme la protection contre le virus, il faut savoir relativiser les enjeux de liberté et de toutes façons nous l’avons déjà accepté avec la traçabilité installée par les plates-formes.

Arguments classiques que j’ai entendus depuis les débuts de la vidéosurveillance et la reconnaissance faciale par exemple et pour toutes les technologies, même la 5G. Arguments en trois temps :

  • la tyrannie du retard ( courons derrière les autres pour ne pas être distancés et donc copions les, ce qui est la meilleure façon d’être dépassés) ;
  • le solutionnisme technologique: Les solutions techniques peuvent résoudre tout type de problèmes, nous devons les utiliser (sans s’occuper de l’origine ni du type de problème) ;
  • la sécurité ne doit jamais freiner la liberté du business mais le business peut sans problème s’affranchir de la liberté de choix et de privacy des personnes (il sera toujours temps de revenir en arrière).

Dans le cas des applications de traçage imaginées pour le coronavirus, le processus peut être détaillé pour montrer que ce qui est en jeu pour l’instant n’est pas un traitement sérieux du problème ( et quel est-il d’ailleurs ?) mais un cadrage a priori, un infra message qui prépare les esprits à des technologies de traçabilité. Le medium est le message, disait Mc Luhan : l’installation de l’application sera le véritable message, à savoir une banalisation de la traçabilité. Et le seul fait de débattre d’un problème sanitaire, social et organisationnel en termes techniques installe une réponse fatale à toutes ces situations : la surveillance numérique.

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Critique de l’entretien avec Didier Raoult à propos de son livre « Dépasser Darwin » (2011)

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Voici un entretien qui peut sembler décalé par rapport à l’objet de ce blog. Il ne s’agit pas de parler de la controverse sur la chloroquine ou sur Raoult mais de revenir sur son livre publié en 2011 (merci Olivier Auber pour le signalement). Pourquoi est-ce intéressant ? D’abord parce que toute étude des propagations ne peut que s’intéresser à Darwin, pour des raisons théoriques de « modélisation » (terme anachronique) de la transmission qui est un cas de propagation et pour des raisons empiriques, ses travaux étant tous basés sur les études des caractères qui se transmettent. Daniel Dennett l’a bien mis en avant dans son ouvrage magistral « Darwin’s Dangerous Idea » dans lequel il étend l’approche de Darwin aux phénomènes culturels, dans le sens de ce qu’on appelle l’évolutionnisme culturel, qui entre directement dans le champ des études de propagation. Ensuite, parce que Didier Raoult apparait bien différent de l’image qui est façonnée dans les médias (au point de devenir en tant que personnage un mème, version Panoramix par exemple). Dans cet entretien (je n’ai pas lu le livre mais je vais le faire), il s’avère être bien plus qu’un chercheur-médecin pragmatique ( ce qu’il défend dans son choix thérapeutique et qui le disqualifie aux yeux de ceux qui veulent une science « pure » et une médecine EBM (evidence based). Il a ici des prétentions théoriques tout-à-fait passionnantes (ou prétentieuses diront ses détracteurs). Enfin et surtout parce que les questions qu’il soulève nous intéresse au plus haut point, notamment la propagation horizontale des virus, qu’évoquait déjà F. Kerk dans l’article republié sur ce blog. La ligne de transmission du capital génétique n’est pas seulement issue d’un héritage mais aussi d’un voisinage, avec des effets de croisement très importants.

Cependant, je ne partage pas la remise en cause de Darwin qu’il fait (et que le journaliste accentue) à partir de là. Il a raison de s’attaquer au darwinisme et à tous ceux qui en ont fait un dogme mais il attribue à Darwin des affirmations schématiques qui n’étaient pas les siennes. La notion d’arbre n’est pas aussi décisive, la notion de progrès dans l’évolution est une réécriture par les darwinistes, voire même par le darwinisme social de Spencer, alors que toute l’évolution est gouvernée par le hasard, ce qui est la grande idée dangereuse de Darwin (et qu’il a en effet évité de trop mettre en avant car cela portait un coup violent à toutes les doctrines religieuses). Mais à partir de là, on peut très bien imaginer des combinaisons horizontales que cite Raoult, après ses découvertes des virus géants notamment et aussi du virophage). Il mentionne « le gène égoïste » reprenant le titre du livre de Dawkins où il parle pour la première fois des mèmes. Mais cela ne remet rien en cause de la théorie de Darwin, au contraire. Bref, alors qu’il est toujours darwinien, il s’attaque au darwinisme et cela ouvre des pistes vraiment très stimulantes, notamment pour comprendre la pandémie actuelle.

Mise à jour: dans le très long article du New York Times magazine  du 12 Mai, il réaffirme cependant que l’évolution vue par Darwin est « entirely false » et que Darwin « wrote nothing but inanities » !!!!!! Ce qui est quand même une marque de démesure et d’hubris qu’il dénonce à juste titre comme le risque ou le défaut de tout scientifique… De quoi remettre en cause ma propre évaluation de l’entretien publié ici!

Mise à jour 2: j’ai profité des vacances pour lire le livre de Raoult. C’est beaucoup plus rapide que je ne le pensais car il s’agit largement d’un livre de vulgarisation, parfois intéressant sur ce plan d’ailleurs. L’argument contre Darwin est avant tout un propos marketing et quand ça ne l’est pas, une prétention tout à fait arrogante comme sait le faire Raoult, c’est dommage. Il admet d’ailleurs souvent que ce n’est pas Darwin qui est visé mais son utilisation notamment par des théories racistes ou des théories finalistes comme celle de Spencer et Raoult admet que Darwin avait raison sur le hasard qui gouverne la variation. Mais il critique ses arbres et montre de façon intéressante que les espèces n’arrêtent pas de se recombiner. La question de la fitness, de la sélection des plus aptes est critiquée mais Raoult reconnait que c’est vrai dans un écosystème donné mais non à échelle générale. La focalisation sur la transmission par descendance (version héritage, verticale) est abusive dit Raoult qui montre de façon intéressante que les emprunts entre virus par exemple se font de façon horizontale aussi. Et cela conduit à reprendre le terme de cousinage entre espèces de Darwin en disant qu’il avait raison. Cela ne fait que la moitié du livre et est assez vite expédié avant que l’auteur expose ses propres points de vue et en profite pour faire un peu d’éducation à la microbiologie. C’est dommage d’en avoir fait un argument de vente alors que ses travaux viennent infléchir ou enrichir la théorie de Darwin mais non l’invalider ( et notamment parce que Darwin ne pouvait rien connaitre de la génétique).

Dans le reste du livre, Raoult développe des thèmes très intéressants comme la globalisation du tube digestif, la pandémie contagieuse qu’est l’obésité et du rôle des outils dans les découvertes ( ce qui fait la base de ma proposition sur les trois générations de sciences sociales). Le microscope change tout en effet mais il faut changer d’échelle parfois et les nouveaux microscopes électroniques permettent d’observer les molécules d’ADN! Mais il faut aller chercher les éléments qui sont à l’extérieur des virus et qui leur permettent pourtant de se fixer dans un véhicule donné. Tout son propos est orienté vers la mise en valeur de l’horizontal, de la recombinaison entre gènes par exemple contre le dogme attribué à Darwin du vertical, de la descendance pure. Approche très stimulante pour notre théorie du voisinage dans le social aussi mais aucune raison pour disqualifier ce qui relève de la transmission héréditaire évidemment. Raoult semble avoir une grande affection pour Deleuze et Guattari et notamment pour le concept de rhizome, ce qui contribuera encore à brouiller son image de mandarin anarchiste de droite qui lui est désormais attachée. Mais le livre manifeste cependant le risque de ces publications dites de vulgarisation , un peu écrites rapidement, il faut bien le dire, emballées par un titre très vendeur et provocateur.

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Propagations et répétition: le syndrome de la machine à laver au temps du coronavirus

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L’analyse des propagations est sans aucun doute utile pour comprendre la période actuelle et le démarrage de l’épidémie a été propice à cette approche classique en notant les pics d’attention et la réplication de certaines thématiques. Pourtant, depuis le confinement, il me semble que nous soyons entrés dans un autre régime d’attention, celui de l’immersion. Aux alertes chocs a succédé le sentiment d’être pris à l’intérieur d’une répétition permanente. Je voudrais examiner ici de quoi est constituée cette répétition et en quoi elle diffère des propagations étudiées le plus souvent dans ce blog.

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